بقعه سید رکن‌الدین یکی از آثار تاریخی و مذهبی مهم شهر یزد است که در خیابان مسجد جامع کبیر، کوچه وقت‌الساعت واقع شده و مربوط به قرن هشتم هجری قمری است.. این بنا در گذشته مدرسه‌ای به نام «مدرسه رکنیه» بوده که توسط سید رکن‌الدین ابوالمکارم محمد قاضی حسینی یزدی، یکی از علمای بزرگ، قاضی القضات و نقیب سادات یزد و مناطق اطراف، ساخته شده است.. پس از وفات وی، پیکرش در همان مدرسه دفن شد و مدرسه به بقعه سید رکن‌الدین تغییر نام یافت.
بقعه دارای معماری چشم‌نواز با تزیینات متنوعی از جمله کاشیکاری‌های زیبا، آرایه‌های گچی برجسته، نقاشی‌های تزیینی و کتیبه‌های تاریخی است که هر بیننده‌ای را مجذوب می‌کند.. گنبد آن با کاشی‌های سفید، فیروزه‌ای و لاجوردی پوشیده شده و فضای آرام و معنوی را برای زائران فراهم می‌کند..
سید رکن‌الدین در قرن هشتم هجری، علاوه بر فعالیت‌های علمی و قضایی، خدمات زیادی در زمینه ساخت مدرسه، مسجد، رصدخانه و قنات انجام داده و نام نیکوی او در تاریخ یزد باقی مانده است. مردم یزد طبق سنتی قدیمی هر چهارشنبه به زیارت این بقعه می‌روند.
این اثر در سال ۱۳۱۴ خورشیدی با شماره ثبت ۲۴۶ به عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده است و امروزه به عنوان یکی از جاذبه‌های گردشگری و مذهبی مهم یزد شناخته می‌شود.
از مکان‌های تاریخی نزدیک میتوان به مسجد جامع یزد، موزه وزیری، کنیسه ملا آقا بابا، بازار نو یزد و میدان ساعت اشاره کرد.
آدرس بقعه سید رکن‌الدین یزد:
یزد، خیابان امام خمینی، خیابان مسجد جامع کبیر، کوچه سید رکن‌الدین (که در گذشته مدرسه رکنیه نامیده می‌شد)